Microbiota bacteriana oral de la tortuga del bolsón Gopherus flavomarginatus en la Reserva de la Biosfera Mapimí, México

Cristina García-De la Peña, Mirsha Rojas-Domínguez, Aurelio Ramírez-Bautista, Felipe Vaca-Paniagua, Clara Díaz-Velásquez, Verónica Ávila-Rodríguez, Luis Manuel Valenzuela-Núñez, César Alberto Meza-Herrera

Resumen


Se determinó la comunidad bacteriana oral de tortugas del Bolsón Gopherus flavomarginatus de la Reserva de la Biosfera Mapimí, México, mediante secuenciación masiva. En 2015 se tomaron muestras a 5 machos y 5 hembras adultos aparentemente sanos; se extrajo el ADN, se amplificaron las regiones V3-V4 16S r ARN, se realizó secuenciación con Illumina y se usó EzBioCloud como base taxonómica de referencia. No se observó diferencia significativa en la microbiota oral entre sexos. Proteobacteria, Actinobacteria y Firmicutes fueron los phyla dominantes, así como la clase Gammaproteobacteria y el orden Pasteurellales. Pasteurellaceae, Moraxellaceae y Micrococcaceae fueron las familias más abundantes. De entre los taxones potencialmente patógenos para tortugas, se registra molecularmente la presencia de Mycoplasma y Pasteurella testudinis en G. flavomarginatus; ambas son consideradas posibles participantes en causar enfermedad respiratoria superior en otras especies de Gopherus. Se reporta por primera vez el género Bergeyella
en la cavidad oral de un reptil; esta bacteria zoonótica solo había sido reportada como parte de la microbiota oral de caninos y felinos. Esta información integra una línea base de diversidad bacteriana oral para esta especie que puede contribuir a mejorar los planes actuales de su conservación y manejo.


Palabras clave


Gen 16S rARN; EzBioCloud; Proteobacteria; Mycoplasma; Pasteurella testudinis

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DOI: http://dx.doi.org/10.22201/ib.20078706e.2019.90.2683

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